Theo kết quả điều tra ban đầu, dự án Khu xử lý nước thải tập trung Cụm Công nghiệp Tân An 1, 2, phường Tân An, TP Buôn Ma Thuột được UBND tỉnh Đắk Lắk phê duyệt vào năm 2010, với tổng mức đầu tư hơn 37 tỉ đồng (điều chỉnh năm 2012), từ nguồn vốn ngân sách tỉnh Đắk Lắk. Chủ đầu tư dự án là UBND TP Buôn Ma Thuột. Ban Quản lý Khu tiểu thủ công nghiệp TP Buôn Ma Thuột được UBND TP Buôn Ma Thuột giao làm đại diện chủ đầu tư dự án.
Ngày 28/12/2012, Ban Quản lý Khu tiểu thủ công nghiệp TP Buôn Ma Thuột tổ chức đấu thầu để lựa chọn nhà thầu thi công, chỉ định tư vấn quản lý và tư vấn giám sát thi công, Cty Tiến Thịnh là đơn vị trúng thầu. Đơn vị tư vấn giám sát thi công là Công ty TNHH Thương mại - Dịch vụ Tư vấn Quốc tế Vạn Hưng Đức (TP Hồ Chí Minh). Đơn vị tư vấn quản lý dự án Công ty TNHH Tư vấn xây dựng A.T, TP Buôn Ma Thuột, tỉnh Đắk Lắk.
Ngày 28/12/2012, đại diện chủ đầu tư đã cho Cty Tiến Thịnh tạm ứng hơn 3,39 tỉ đồng. Theo trình tự thực hiện của dự án và hồ sơ thiết kế, thi công, sau khi thực hiện xong phần thi công xây dựng sẽ tiến hành phần lắp đặt thiết bị.
Dù không thể làm được hạng mục xây dựng công trình để kịp nghiệm thu, thanh toán theo tiến độ giải ngân kinh phí, ông Phan Xuân Mạo và ông Nguyễn Minh Tiến cùng thống nhất để Cty Tiến Thịnh lập hồ sơ nghiệm thu phần máy móc thiết bị trước để giải ngân vốn (giá trị theo hợp đồng về máy móc, thiết bị là hơn 10,3 tỉ đồng).
Tiếp đó, Cty Tiến Thịnh ký hợp đồng với Công ty TNHH Công nghệ Môi trường Nông Lâm (Cty Nông Lâm) để cung cấp, lắp đặt thiết bị cho hệ thống xử lý nước thải công suất 1.500 m3/ngày đêm, đã xuất hóa đơn cho hợp đồng theo giá trị đã ký nhưng Công ty Nông Lâm chỉ giao cho Công ty Tiến Thịnh bản photocopy liên 2 tờ hóa đơn, với tổng giá trị bao gồm thuế giá trị gia tăng hơn 6,1 tỉ đồng.
Sau đó, Cty Tiến Thịnh đã xuất cho Ban Quản lý Khu tiểu thủ công nghiệp TP Buôn Ma Thuột hóa đơn GTGT tổng trị giá trị bao gồm cả thuế hơn 9,5 tỉ đồng. Số tiền này cũng tương ứng với hồ sơ nghiệm thu thanh toán đợt 1 phần máy và thiết bị công nghệ.
Từ năm 2012-2016, UBND tỉnh Đắk Lắk đã bố trí vốn cho dự án tổng số tiền hơn 18,8 tỉ đồng. Trong đó, Ban Quản lý Khu tiểu thủ công nghiệp TP Buôn Ma Thuột đã nghiệm thu thanh toán cho Cty Tiến Thịnh tổng số tiền hơn 16 tỉ đồng. Số tiền còn lại đã thanh toán cho các đơn vị tư vấn thiết kế; tư vấn giám sát thi công, tư vấn quản lý dự án và các chi phí khác.
Ngày 26/4/2016, UBND TP Buôn Ma Thuột có quyết định thanh tra trách nhiệm các vấn đề liên quan tại Ban Quản lý Khu tiểu thủ công nghiệp TP Buôn Ma Thuột. Trobg quá trình kiểm tra, xác minh, đoàn thanh tra xác định việc nghiệm thu, thanh toán đối với hạng mục phần máy và thiết bị công nghệ không có cơ sở pháp lý về khối lượng với tổng giá trị hơn 9,5 tỉ đồng nên đã báo cáo Chủ tịch UBND TP Buôn Ma Thuột để chuyển đến Cơ quan Công an TP.Buôn Ma Thuột giải quyết theo quy định pháp luật...
Theo cơ quan chức năng, giá trị chênh lệch do chủ đầu tư đã thanh toán cho đơn vị thi công đến thời điểm hiện nay không có khối lượng thi công thực tế, gây hậu quả thiệt hại tài sản Nhà nước số tiền hơn 7,9 tỉ đồng.
Hiện cơ quan chức năng tỉnh Đắk Lắk đang tiếp tục điều tra mở rộng vụ án.