Theo Trung tâm kiểm soát bệnh tật tỉnh Thanh Hóa, khoảng 12h30 ngày 6/9, khi biết tin tàu AUVIRGO có 21 thuyền viên mang quốc tịch Indonesia di chuyển từ cảng Belawan – Indonesia chở gần 4.300 tấn dầu ăn đi từ Singapore sẽ đến khu vực gần Cảng Nghi Sơn, ngay sau đó, cán bộ kiểm dịch y tế tại Thanh Hóa đã di chuyển ra tàu, thực hiện test nhanh kháng nguyên SARS-CoV-2 cho các thuyền viên. Kết quả có 2 trường hợp là bếp trưởng và 1 thủy thủ dương tính với SARS-CoV-2.
Cán bộ kiểm dịch y tế đã thực hiện cách ly toàn bộ thuyền viên tại tàu, lấy mẫu bệnh phẩm gửi về Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Thanh Hóa làm xét nghiệm SARS-CoV-2 bằng phương pháp RT-PCR. Đến 23h ngày 6/9 khẳng định kết quả 2 mẫu dương tính với SARS-CoV-2.
Ngay trong đêm 6/9, lực lượng chức năng tỉnh Thanh Hóa đã đưa 2 bệnh nhân về Bệnh viện Phổi Thanh Hóa cách ly và điều trị, đồng thời phun khử khuẩn toàn bộ tàu, khu vực cầu cảng tàu neo đậu và các khu vực có liên quan; điều động tàu ra khu vực neo đậu cùng 19 thuyền viên thực hiện cách ly y tế tại tàu theo quy định.