Theo đó, Ban chỉ đạo có nhiệm vụ căn cứ vào diễn biến dịch bệnh, kịp thời xây dựng kế hoạch, phương án, giải pháp, kinh phí phòng chống dịch cụ thể và tham mưu UBND TP chỉ đạo, triển khai các giải pháp hữu hiệu.
Đồng thời, Ban chỉ đạo đôn đốc, kiểm tra, giám sát hoạt động phòng chống dịch của các cấp, ngành, địa phương, đơn vị; xem xét các đề xuất, giải pháp của Tổ tư vấn về chính sách phòng chống dịch và phục hồi kinh tế tại TP.HCM để chỉ đạo thực hiện.
Ông Phan Văn Mãi, Chủ tịch UBND TP.HCM, làm Trưởng ban Chỉ đạo phòng, chống dịch Covid-19 TP.HCM thay ông Nguyễn Thành Phong; chịu trách nhiệm chỉ đạo, điều hành chung các hoạt động của Ban Chỉ đạo phòng, chống dịch Covid-19 TP.HCM; chỉ đạo, phân công nhiệm vụ cho các thành viên. Ông cũng trực tiếp chỉ đạo Ban Chỉ đạo Xây dựng kế hoạch phòng, chống dịch Covid-19 và phục hồi kinh tế Thành phố.
12 Phó ban chỉ đạo giúp việc Trưởng Ban gồm:
1. Ông Dương Anh Đức, Phó chủ tịch UBND TP.
2. Ông Nguyễn Hồ Hải, Phó bí thư Thành ủy TP.
3. Bà Tô Thị Bích Châu, Chủ tịch Ủy ban MTTQ Việt Nam TP.
4. Ông Phan Nguyễn Như Khuê, Trưởng ban Tuyên giáo Thành ủy TP.
5. Ông Nguyễn Hữu Hiệp, Trưởng ban Dân vận Thành ủy TP.
6. Ông Lê Hòa Bình, Phó chủ tịch UBND TP.
7. Bà Phan Thị Thắng, Phó chủ tịch UBND TP.
8. Ông Võ Văn Hoan, Phó chủ tịch UBND TP.
9. Ông Ngô Minh Châu, Phó chủ tịch UBND TP.
10. Ông Tăng Chí Thượng, Giám đốc Sở Y tế.
11. Ông Phan Trọng Lân, Viện trưởng Viện Pasteur TP.HCM
12. Ông Phạm Đức Hải, nguyên Phó chủ tịch HĐND TP.
Ngoài ra, Ban chỉ đạo còn có 35 thành viên khác, trong đó, GS.TS Nguyễn Tấn Bỉnh làm thành viên thường trực.
UBND TP.HCM cũng kiện toàn tổ giúp việc cho Ban chỉ đạo gồm 29 thành viên.