Theo Trung tâm Dự báo Khí tượng Thủy văn Quốc gia, từ khoảng đầu tháng 6/2021, MJO (Madden-Julian Oscillation là một dao động nội mùa trong khu vực nhiệt đới) có khả năng tác động đến thời tiết khu vực Nam Bộ, gió mùa Tây Nam cũng có xu hướng hoạt động mạnh dần.
Tại Bắc Bộ và Trung Bộ, do ảnh hưởng của rãnh áp thấp bị nén kết hợp hội tụ gió trên cao có khả năng gây mưa dông diện rộng trong tháng 6/2021. Tuy nhiên, trong 3-4 ngày đầu tháng Bắc Bộ và Trung Bộ duy trì nắng nóng gay gắt, có nơi đặc biệt gay gắt, sau đó nhiệt độ giảm và đến nửa cuối tháng 6/2021, nắng nóng xảy ra nhiều ngày tại khu vực Bắc Bộ và Trung Bộ, mưa có xu hướng giảm.
Trong nửa cuối tháng 6/2021, xoáy thuận nhiệt đới có thể xuất hiện trên khu vực Biển Đông, nhưng ít khả năng ảnh hưởng đến đất liền nước ta, chủ yếu chỉ gây thời tiết xấu trên biển. Trên phạm vi cả nước, tiếp tục đề phòng các hiện tượng thời tiết cực đoan như lốc, sét, mưa đá và gió giật mạnh. Tại Bắc Bộ, nhiệt độ trung bình phổ biến cao hơn 0,5-1 độ C so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ. Tại Trung Bộ, nhiệt độ trung bình phổ biến cao hơn 0,5-1,5 độ C so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ. Tây Nguyên và Nam Bộ nhiệt độ trung bình phổ biến xấp xỉ so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ.
Từ ngày 1-10/6, khu vực Bắc Bộ chịu tác động của vùng áp thấp nóng phía Tây, khu vực Bắc Bộ và từ Thanh Hóa đến Phú Yên có nắng nóng và nắng nóng gay gắt; trong đó khu vực Tây Bắc của Bắc Bộ,vùng núi phía Tây của Trung Bộ có nơi nắng nóng đặc biệt gay gắt.
Khoảng từ chiều tối ngày 3/6, do ảnh hưởng của rãnh áp thấp bị nén kết hợp hội tụ gió trên tầng cao, Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ có mưa dông diện rộng.
Từ ngày 7-11/6 khu vực Bắc Bộ và Thanh Hóa có mưa vừa, mưa to, có nơi mưa rất to và dông mạnh, trong cơn dông có khả năng xảy ra lốc, sét, mưa đá và gió giật mạnh. Tổng lượng mưa tại khu vực Bắc Bộ vùng núi phía Bắc xấp xỉ so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ, các khu vực còn lại phổ biến cao hơn từ 15-30%, riêng các tỉnh đồng bằng Bắc Bộ cao hơn 30-50%. Khu vực Trung Bộ từ Thanh Hóa đến Thừa Thiên-Huế phổ biến cao hơn từ 20-40% so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ, các khu vực còn lại phổ biến thấp hơn từ 15-30%. Nhiệt độ trung bình tại Bắc Bộ, Trung Bộ cao hơn từ 1,0-1,5 độ C; khu vực còn lại phổ biến cao hơn 0,5-1 độ C so với trung bình nhiều năm cùng thời kỳ.
Từ ngày 11-20/6, nhiệt độ trung bình tại Bắc Bộ và Trung Bộ phổ biến cao hơn khoảng 0,5-1 độ C so với trung bình nhiều năm, các nơi khác phổ biến xấp xỉ trung bình nhiều năm. Tổng lượng mưa trên cả nước phổ biến thấp hơn trung bình nhiều năm cùng thời kỳ từ 15-30%, riêng khu vực Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ phổ biến xấp xỉ trung bình nhiều năm.
Từ ngày 21-30/6, nhiệt độ trung bình tại Bắc Bộ và Trung Bộ phổ biến cao hơn khoảng 0,5-1 độ C so với trung bình nhiều năm, các nơi khác phổ biến xấp xỉ trung bình nhiều năm. Tổng lượng mưa trên cả nước phổ biến thấp hơn trung bình nhiều năm cùng thời kỳ từ 15-30%, riêng khu vực Tây Bắc Bộ phổ biến xấp xỉ trung bình nhiều năm.