Nhóm nghiên cứu Covid-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford đã tiến hành giải mã nhanh bộ gene của SARS-CoV-2 từ bệnh nhân BN4583 cư ngụ tại Quận 7.
Bệnh nhân này có liên quan đến BN4514 cư trú tại Thành phố Thủ Đức. Đây là chùm ca lây nhiễm tại cộng đồng ghi nhận hôm 18/5/2021. Kết quả giải mã gene cho thấy BN4583 nhiễm biến chủng B.1.617.2 của Ấn Độ. Về BN4780 liên quan đến chuỗi lây nhiễm tại Quận 3 ghi nhận hôm 20/5/2021, giải mã bộ gene vi rút cho kết quả nhiễm biến chủng B.1.1.7 của Anh.
Trong ngày 18, 20/5 ghi nhận 2 chuỗi lây nhiễm trong cộng đồng. 01 chuỗi lây nhiễm tại một công ty ở quận 3 với hai bệnh nhân là BN4514, BN4583.
Kết hợp kết quả giải mã gene với thông tin dịch tễ có thể khẳng định: hai bệnh nhân BN4583 và BN4514 có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2 (biến chủng Án Độ). BN4780 nhiễm biến chủng B.1.1.7. Biến chủng B.1.1.7 gây bệnh tại Đà Nẵng và Hà Nam. Hai chuỗi lây nhiễm này do hai biến chủng khác nhau gây bệnh. Đây là lần đầu tiên TP.HCM ghi nhận sự lây nhiễm trong cộng đồng đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh.
Được biết nhóm nghiên cứu sử dụng phương pháp giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION. Phần mềm lắp ghép bộ gene Genious. Định danh biến chủng bằng phần mềm Pangolin và tìm đột biến bằng phần mềm COV-GLUE.
Kết quả thu nhận được hai bộ gene SARS-CoV-2 từ 02 mẫu RNA đưa vào phân tích. Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy: mẫu từ BN4583 là B.1.617.2, mẫu từ BN4780: B.1.1.7. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy các bộ gene thu nhận chứa các đột biến tiêu biểu của biến chủng B.1.1.7 và biến chủng B.1.617.2 tương ứng.
Trong ngày 21/5,TP.HCM không ghi nhận trường hợp nhiễm mới. Có thêm 2 trường hợp xuất viện. Số trường hợp nhiễm Covid-19 phát hiện tại thành phố là 276, trong đó 259 trường hợp đã điều trị khỏi bệnh, 17 đang điều trị.
Trong ngày 18, 20/5 ghi nhận 2 chuỗi lây nhiễm trong cộng đồng. 1 chuỗi lây nhiễm tại một công ty ở quận 3 với hai bệnh nhân là BN4514, BN4583. Kết quả giải mã bộ gen của vi rút cho thấy 2 bệnh nhân này có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2 (biến chủng Ấn Độ)
Chuỗi lây nhiễm tại một quán ăn ở quận 3 gồm các bệnh nhân: BN4780, BN4781, BN4782. Kết quả giải mã bộ gen vi rút trên BN4780 cho thấy bệnh nhân nhiễm biến chủng B.1.1.7 (biến chủng Anh). Đây là lần đầu tiên TP.HCM ghi nhận sự lây nhiễm trong cộng đồng đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh.
Trường hợp bệnh nhân tại quận Gò Vấp được ghi nhận là ca nghi ngờ từ chiều tối 20/5, đến nay vẫn đang chờ kết quả xét nghiệm khẵng định. Do là ca nghi ngờ nên thành phố xử trí giống như một ca nhiễm.