Dự án này sẽ thuộc địa giới hành chính các xã Liệp Tuyết, Ngọc Mỹ và Ngọc Liệp, huyện Quốc Oai, TP Hà Nội. Quy mô diện tích khu đất đề xuất nghiên cứu lập Quy hoạch chi tiết khoảng 38.28 ha, gồm các khu chức năng như: Khu trưng bày đa năng kết hợp học tập; Khu tiếp đón và trưng bày chuyên đề; Khu dịch vụ; Khu trung tâm nghiên cứu và văn phòng; Khu kỹ thuật và chế tác mẫu vật; Khu cây xanh tập trung; Khu rừng kín thường xanh...
Bảo tàng chính cao 2 - 5 tầng có hình khối đặc trưng theo ngôn ngữ kiến trúc bảo tàng; Khu dịch vụ đa năng, trung tâm nghiên cứu và văn phòng… cao 1 - 4 tầng có lối tiếp cận riêng; Các giải pháp về trục không gian kiến trúc cảnh quan, không gian cây xanh, sân chơi vườn hoa…
Sau khi đồ án quy hoạch này được duyệt sẽ là cơ sở để lập dự án đầu tư xây dựng Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam thành một bảo tàng thiên nhiên cấp quốc gia có cơ sở vật chất, hạ tầng kỹ thuật hiện đại. Bảo tàng sẽ thực hiện được các chức năng của một bảo tàng thiên nhiên có tầm cỡ, đáp ứng nhiệm vụ bảo tồn di sản văn hoá, khoa học nghiên cứu, giáo dục khoa học, phục vụ lợi ích cộng đồng.
UBND thành phố giao UBND huyện Quốc Oai chủ trì, phối hợp với Sở Quy hoạch - Kiến trúc và Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam tổ chức công bố công khai quy hoạch chi tiết được duyệt cho các tổ chức, cơ quan và nhân dân biết, thực hiện.
Chủ tịch UBND huyện Quốc Oai, Chủ tịch UBND các xã Liệp Tuyết, Ngọc Mỹ và Ngọc Liệp chịu trách nhiệm kiểm tra, quản lý giám sát xây dựng theo quy hoạch, xử lý các trường hợp xây dựng sai quy hoạch theo thẩm quyền và quy định của pháp luật.