Quỹ phòng, chống thiên tai tỉnh Quảng Ngãi do UBND tỉnh Quảng Ngãi quản lý; Quỹ không bao gồm ngân sách nhà nước và không có nguồn gốc từ ngân sách nhà nước. Quỹ có tư cách pháp nhân, có con dấu và được mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước theo quy định của pháp luật.
Trụ sở Cơ quan Quản lý Quỹ được đặt tại Chi cục Thủy lợi trực thuộc Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.
Ông Dương Văn Tô-GĐ sở NN&PTNT Quảng Ngãi thị sát vùng lũ lụt năm 2016.
Giám đốc Cơ quan quản lý Quỹ do Giám đốc Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn kiêm nhiệm; Phó Giám đốc Cơ quan quản lý Quỹ do Chi cục trưởng Chi cục Thủy lợi - Chánh Văn phòng thường trực Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn tỉnh kiêm nhiệm; Kế toán trưởng Cơ quan quản lý Qũy do Kế toán trưởng Chi cục Thủy lợi kiêm nhiệm; Bộ phận nghiệp vụ Cơ quan quản lý Qũy sử dụng bộ phận nghiệp vụ của Chi cục Thủy lợi - Văn phòng thường trực Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn tỉnh.