Trung tâm Công nghệ phòng chống Covid-19 quốc gia là đầu mối điều phối cơ quan, tổ chức, doanh nghiệp cùng hỗ trợ, hợp tác về kỹ thuật, công nghệ chống dịch.
Trung tâm là một cơ cấu làm việc mang tính linh hoạt, không phải là một tổ chức hành chính, không phát sinh thêm tổ chức, biên chế, địa điểm tại tầng 14, trụ sở Cục Tin học hóa, tòa nhà VNTA, số 68 Dương Đình Nghệ, quận Cầu Giấy, Hà Nội. Ông Đỗ Công Anh, Phó cục trưởng Tin học hóa, là giám đốc Trung tâm, điều hành chung.
Lực lượng của Trung tâm hoạt động 24h mỗi ngày, nhằm thiết kế, tổ chức xây dựng, quản lý, vận hành, giám sát, bảo đảm an toàn, an ninh mạng cho các nền tảng, hệ thống công nghệ chống dịch.
Trung tâm còn chịu trách nhiệm quản lý và phân phối dữ liệu khai báo y tế điện tử; khai báo di chuyển nội địa; phản ánh của người dân; dữ liệu kiểm dịch; kiểm soát vào ra tại các điểm kiểm dịch.
Ngoài ra, Trung tâm sẽ phát triển hoặc nhận chuyển giao công nghệ mới trong phòng chống dịch; hỗ trợ Bộ Y tế, các địa phương.