Nội dung thanh tra Bộ Y tế và các đơn vị trực thuộc liên quan đến việc thực hiện quy định về tự chủ theo các Nghị định 43/2006/NĐ-CP, Nghị định 16/2015/NĐ-CP của Chính phủ; việc quản lý đầu tư xây dựng 2 bệnh viện trọng điểm theo Đề án 125: Bệnh viện Nhi đồng Thành phố Hồ Chí Minh, Bệnh viện 175 Bộ Quốc phòng.
Phó Tổng Thanh tra Chính phủ Đặng Công Huẩn, Thứ trưởng Bộ Y tế Trương Quốc Cường cùng đại diện lãnh đạo bộ, thanh tra bộ và các thành viên đoàn thanh tra cùng tham dự.
Theo Quyết định số 2199/QĐ-TTCP ngày 31/8/2017 của Tổng Thanh tra Chính phủ, đoàn thanh tra có 13 thành viên do ông Phan Thăng Long, Phó Vụ trưởng Vụ III, Thanh tra Chính phủ làm Trưởng đoàn. Đoàn Thanh tra có nhiệm vụ tiến hành thanh tra theo nội dung quy định và kế hoạch tiến hành thanh tra được phê duyệt.
Ông Đặng Công Huẩn - Phó Tổng Thanh tra Chính phủ công bố quyết định thanh tra
Theo quyết định của Tổng Thanh tra Chính phủ, thời kỳ thanh tra từ năm 2013-2016; khi cần có thể xem xét trước hoặc sau thời kỳ trên.
Thời hạn thanh tra 70 ngày làm việc thực tế (không kể ngày nghỉ, ngày lễ) kể từ ngày công bố quyết định thanh tra.
Các cục vụ liên quan có Vụ Kế hoạch tài chính, Vụ trang thiết bị y tế, Ban quản lý dự án trọng điểm...
Trong những năm qua, Bộ Y tế đã thực hiện xây dựng 5 bệnh viện trọng điểm với tổng kinh phí khoảng 20.000 tỷ đồng, trong đó 3 bệnh viện ở Thành phố Hồ Chí Minh và 2 bệnh viện ở tỉnh Hà Nam.