Theo báo cáo, quỹ đất còn lại của Khu đô thị mới Thủ Thiêm là 55 lô, diện tích gần 794.000m2. Nguồn thu khai thác dự kiến do đơn vị tư vấn đề xuất tính theo giá trị quyền sử dụng đất thời điểm 2016 - 2017 của toàn bộ quỹ đất là gần 22.000 tỷ đồng. Quỹ đất còn lại dự kiến sẽ được chia thành 3 nhóm tương ứng với tiến độ thực hiện quyền đấu giá sử dụng đất và đấu thầu lựa chọn nhà đầu tư.
Nhóm 1 gồm 16 lô đất (khoảng hơn 158.700m2) đã hoàn tất công tác giải phóng mặt bằng và đang đầu tư xây dựng hạ tầng kỹ thuật, có thể đấu giá quyền sử dụng đất trong quý 4/2019. Nguồn thu dự kiến là gần 4.789 tỷ đồng. Trong đó có 6 lô đất thuộc khu chức năng số 1, 9 lô đất khu chức năng số 2 và 1 lô đất khu chức năng số 7.
Nhóm 2 cũng gồm 16 lô đất (khoảng hơn 269.100m2) với nguồn thu dự kiến hơn 8.125 tỷ đồng. Các lô đất này sẽ đấu giá quyền sử dụng đất và đấu thầu lựa chọn nhà đầu tư sau khi xây dựng hạ tầng kỹ thuật. Các lô đất này dự kiến đấu giá trong năm 2020.
Nhóm 3 gồm 23 lô đất (khoảng hơn 365.200m2) chưa hoàn thành giải phóng mặt bằng. Nguồn thu dự kiến hơn 9.000 tỷ đồng.
Trong số này có 6 lô đất thuộc khu chức năng 2a (khoảng hơn 75.000m2) đang vướng công tác bồi thường giải phóng mặt bằng (Nhà thờ Thủ Thiêm và Dòng mến Thánh giá) nên chưa thu hồi được đất. Sau khi có chủ trương về việc sắp xếp 2 cơ sở tôn giáo tại các lô đất này mới tiến hành kêu gọi đầu tư. Theo phương án trước đây, dự kiến nguồn thu từ 6 lô đất này là hơn 2.438 tỷ đồng.
Theo Ban Quản lý Khu Thủ Thiêm, với tiến độ như trên, dự kiến năm 2019 chỉ thu được khoảng 14.725 tỷ đồng. Trong đó, gần 4.789 tỷ đồng từ đấu giá 16 lô đất đã hoàn tất giải phóng mặt bằng, đấu giá 3.790 căn hộ tái định cư dôi dư thu được hơn 9.936 tỷ đồng. Tính đến hết tháng 9/2018, tổng nguồn thu từ khai thác quỹ nhà, nền đất trong Khu đô thị mới Thủ Thiêm đã nộp vào ngân sách thành phố là hơn 14.253 tỷ đồng.