Trên địa bàn Nghệ An hiện có 47 dự án nhà máy thủy điện được phê duyệt quy hoạch, với tổng công suất 1.423,6 MW. Quá trình thực hiện, UBND tỉnh Nghệ An đã chỉ đạo rà soát, đánh giá và đề nghị Bộ Công Thương loại khỏi quy hoạch 15 dự án với tổng công suất 46,15 MW do hiệu quả thấp.
Bên cạnh đó, có 3 dự án với tổng công suất 276 MW đang thực hiện công tác đầu tư xây dựng công trình (gồm Tiền Phong, Nậm Mô 1, Mỹ Lý) nhưng đã bộc lộ nhiều tồn tại như di dân quá lớn so với quy định tương ứng với MW. Triển khai kéo dài, ảnh hưởng đến cuộc sống người dân và kế hoạch đầu tư phát triển của địa phương.
Hiện Nghệ An có 21 dự án đã vận hành phát điện với tổng công suất 930,9 MW. Tuy nhiên, sản lượng điện phát 10 tháng (năm 2020) từ các nhà máy thủy điện là 1,959 tỷ kWh, đạt 87% so với cùng kỳ năm 2019 và đạt 60% kế hoạch đề ra.
Ngoài ra, việc giải quyết các tồn tại, vướng mắc thực hiện về công tác tái định cư, ổn định sản xuất và đời sống nhân dân do ảnh hưởng của các dự án thủy điện như thủy điện Hủa Na, Khe Bố... kéo dài từ nhiều năm nay vẫn chưa dứt điểm, gây bức xúc cho nhân dân...