Sau khi Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội có quyết định cuối cùng về tổ chức kỳ thi này cho học sinh của thành phố, tính đến hết ngày 5/6/2021, tất cả các trường THPT chuyên, trường THPT chất lượng được phụ huynh quan tâm trực thuộc các trường đại học trên địa bàn Hà Nội đã chốt thời gian tổ chức tuyển sinh lớp 10
Theo đó, lịch thi của trường THPT chuyên Sư phạm, trường Đại học Sư phạm Hà Nội bị trùng với lịch thi của trường THPT Khoa học Giáo dục, Trường Đại học Giáo dục, Đại học Quốc gia Hà Nội, tổ chức ngày 17/6. Tương tự, Trường THPT chuyên Khoa học Tự nhiên, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội tổ chức tuyển sinh vào lớp 10 trùng ngày với Trường THPT chuyên Ngoại ngữ, Đại học Ngoại ngữ, Đại học Quốc gia Hà Nội, ngày 15/6; Trường THPT chuyên Khoa học Xã hội và Nhân văn, trường Đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn, Đại học Quốc gia Hà Nội trùng với lịch thi của Trường THPT Nguyễn Tất Thành, trường Đại học Sư phạm Hà Nội, tổ chức ngày 19/6.
Mọi năm, thí sinh sẽ có ít nhất cơ hội vào 6 trường THPT chuyên hoặc THPT chất lượng trực thuộc các trường Đại học (trường Đại học Sư phạm, trường Đại học Khoa học Tự nhiên, trường Đại học Ngoại ngữ, trường Đại học Giáo dục, trường Đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn).
Như vậy, so với những năm trước, thí sinh bị giảm 50% cơ hội dự thi vào các trường THPT chuyên hay các trường THPT chất lượng cao trực thuộc các trường đại học trên địa bàn Hà Nội.
Do tình hình dịch bệnh, thời gian làm bài của các thí sinh cũng được giảm xuống: Trường THPT chuyên Khoa học Tự nhiên giảm thời gian làm bài 2 môn thi điều kiện là môn Ngữ văn từ 90 phút xuống 75 phút, Toán (vòng 1) từ 120 phút xuống 90 phút. Trường THPT chuyên Sư phạm Hà Nội quyết định điều chỉnh cả 3 bài thi môn Toán, Ngữ Văn và môn chuyên.
Theo đó, thời gian thi môn Toán và Ngữ văn sẽ chỉ diễn ra trong vòng 90 phút (giảm 30 phút so với trước đây); môn chuyên thống nhất đều là 120 phút. (thay vì trước đây chỉ 2 môn Hóa học và Tiếng Anh là 120 phút, số còn lại là 150 phút).