Đội tuyển Việt Nam tham dự Kỳ thi năm nay có 5 thành viên, được tuyển chọn từ những học sinh xuất sắc đạt giải trong Kỳ thi học sinh Giỏi quốc gia năm học 2020-2021 và được Hội Vật lý Việt Nam thành lập trên cơ sở lựa chọn qua 2 vòng thi vào tháng 4/2021, gồm có:
Nguyễn Thanh Bình, học sinh lớp 12, Trường THPT chuyên Bắc Giang; Ngô Trí Cảnh, học sinh lớp 11, Trường Trung học Phổ thông chuyên Phan Bội Châu, Nghệ An; Trần Dương Chính, học sinh lớp 12, Trường Trung học Phổ thông chuyên Hùng Vương, Phú Thọ; Lưu Minh Thắng, học sinh lớp 12, Trường Trung học Phổ thông chuyên Bắc Ninh; Võ Minh Tiến, học sinh lớp 12, Trường Trung học Phổ thông chuyên Nguyễn Du, Đắk Lắk.
Do dịch bệnh Covid-19, Kỳ thi EuPhO 2021 được tổ chức trực tuyến. Dẫn đội Việt Nam là Phó Giáo sư, Tiến sĩ Nguyễn Cao Khang - Giảng viên Trường Đại học Sư phạm Hà Nội và Tiến sĩ Nguyễn Công Toản - Giáo viên Trường Trung học Phổ thông chuyên Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội.
Theo lịch thi, ngày 18/6, các đoàn họp trực tuyến; các thí sinh tham gia Cuộc thi làm bài thi lý thuyết và thực hành trong ngày 19 và 20/6; thời gian thi chính thức đối với phần thi lý thuyết là từ 14h-19h ngày 19/6 (thứ 7); thi thực hành từ 14h-19h ngày 20/6. Trong 2 ngày này, thời gian từ 9h đến 14h, học sinh phải cách ly trong phòng thi dưới sự giám sát của camera và giám thị. Học sinh không sử dụng điện thoại và các phương tiện liên lạc.
Thời gian Ban Giám khảo chấm bài diễn ra trong các ngày 21-23/6. Ngày 24/6, diễn ra tranh biện điểm của thí sinh và cùng lên điểm vào ngày 25/6. Lễ bế mạc vào 21h ngày 26/6.
Kết quả kỳ thi, Trần Dương Chính, học sinh lớp 12, Trường Trung học Phổ thông chuyên Hùng Vương (tỉnh Phú Thọ) đã xuất sắc giành Huy chương Vàng.
Nguyễn Thanh Bình, học sinh lớp 12, Trường THPT chuyên Bắc Giang giành Huy chương Đồng.
Tại kỳ thi năm nay, EuPhO có 46 quốc gia dự thi với 220 thí sinh, Trần Dương Chính, Đoàn Việt Nam là 1 trong 5 thí sinh có điểm cao nhất kỳ thi.